پیشگویی پروتئین های ضدیخ با استفاده از روشهای محاسباتی مبتنی بر اطلاعات موجود در توالی
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه اراک - دانشکده فنی
- نویسنده مرتضی اسلامی
- استاد راهنما رضا رافع سیدجواد ظهیری
- سال انتشار 1393
چکیده
برخی از موجودات سردزی پروتئینی به نام پروتئین های ضدیخ را تولید می کنند که مایع های سلول را دربرابر یخ زدگی محافظت می کنند. این دسته از پروتئین ها در افزایش تحمل دانه های گیاهان در برابریخ زدگی، نگهداری بافت ها در شرایط سرد و تولید گیاهان سردزی کاربرد دارند. شناسایی پروتئین های ضدیخ به خاطر شباهت بسیار کم توالی ها مشکل می باشد. برخی از محققین این موضوع را جهت مطالعه انتخاب کردند اما هنوز درصد دقت پیشگویی به مرز قابل قبولی نرسیده است. ما روشی برای تشخیص پروتئین های ضدیخ ارائه دادیم که از ماشین بردار پشتیبان به عنوان طبقه بندی کننده و اجتماع چهار دسته از ویژگی های آب دوستی، خواص فیزیکی وشیمیایی، درصد حضور اسید های آمینه و اطلاعات تکاملی به عنوان بردار ویژگی استفاده می کند. نتایج تجربی نشان می دهد که روش پیشنهادی کارایی بهتری نسبت به دیگر کارهای انجام شده مشابه در این زمینه دارد.
منابع مشابه
پیشگویی برهم کنش پروتئین و rna با استفاده از روش های یادگیری ماشین بر اساس اطلاعات موجود در توالی پروتئین و rna
بسیاری از عملکردهای rna به تعاملات بین rna و پروتئین ها وابسته است چنانکه درک مکانیزم مولکولی تعاملات rna و پروتئین یکی از مباحث اصلی در علم بیوانفورماتیک به شمار می رود. تعاملات پروتئین و rna نقش مهمی در گستره ی وسیعی از فرآیندهای مختلف سلولی از جمله پیوند و ساخت پروتئین، بیان ژن، پردازش rna، مکانیزم دفاع سلولی و تنظیم رونویسی در بیان ژن جهت مقابله با عوامل بیماری زا دارند. روش های آزمایشگاهی ...
اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملتخمین SNR ورودی با استفاده از ماسک باینری در سیستم‌های مبتنی بر آنالیز ترکیب شنیداری محاسباتی
در این مقاله، روش جدیدی برای تخمین نسبت سیگنال به نویز (SNR) سیگنال ترکیب ارائه شده است که بر پایه روش آنالیز ترکیب شنیداری محاسباتی (CASA) است. در روش ارائه‌شده، ماسک باینری ایده‌آل (IBM) که به طور معمول هدف محاسباتی سیستم‌های مبتنی بر CASA است، برای تخمین SNR سیگنال گفتار نویزی به کار گرفته می‌شود. روش پیشنهادی با استفاده از IBM و چندین ماسک شبه IBM ارزیابی شده است. این روش، ساده و از نظر محا...
متن کاملپیشگویی خواص ماکرو ملکولها با استفاده از روشهای مبتنی بر منطق فازی
امروزه روشهای حسابگری در کاربردهای زیستی بسیار بکار گرفته می شوند و کاربرد فراوانی در زمینه های بازشناسی و پیشگویی ساختار، خواص و کارکرد ماکروملکولها پیدا کرده اند. در بسیاری از این کاربردها، عمل پیشگویی درواقع نوعی مساله بازشناسی الگو می باشد. در بسیاری از مسائل بازشناسی الگو (pattern recognition)با طبقه بندی مشاهداتی مواجهیم که به صورت بردار یا رشته (sequence)هایی از متغیرهای تصادفی ن...
15 صفحه اولشبیه سازی رواناب های سطحی با استفاده از مدل مبتنی بر سامانه اطلاعات جغرافیایی لیسم (LISEM)
شبیه‌سازی پدیده رواناب ناشی از هر بارندگی در برآورد شدت سیل بسیار ارزشمند است. برای حفاظت حوزه‌های آبخیز، استفاده از مدلی که توانایی برآورد رواناب را در زمان‌ها و مکان‌های معین داشته باشد، ضروری است. این پژوهش به منظور شبیه‌سازی رواناب در زیر حوزه زراعی منتهی به شهرک بهزیستی گرگان و همچنین ارزیابی تأثیر سناریوهای مدیریتی پوشش گیاهی در 3 رویداد بارش در سال‌های گذشته با استفاده از مدل فیزیکی لیسم...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه اراک - دانشکده فنی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023